Par mums

Pauls Pumpēns , Dr. habil. biol.

E-pasts: paul@biomed.lu.lv

Pauls Pumpēns ir viens no molekulārās bioloģijas pamatlicējiem Latvijā, kura darbības kodols ir gēnu un proteīnu inženierijas metodoloģiju pielietojums rekombinanto vakcīnu izstrādē uz vīrusveidīgās daļiņu bāzes. Akad. P.Pumpēns ir VLP stratēģijas viens no vadošajiem pētniekiem pasaulē, kurš vadījis daudzus starptautiskus projektus par VLP tematiku, kā arī sadarbību ar Šveices biotehnoloģisko kompāniju Cytos Biotechnology, kas izstrādā vakcīnu prototipus uz VLP bāzes. Zinātniskās darbības spektrs: RNS fāgu replikācijas mehānismi, to kapsīdu uzbūve, proteīnu struktūra un foldings, RNS fāgu genoma struktūra, hepatīta B vīrusa genoma klonēšana un ekspresija, HIV proteīnu īpašības un tos kodējošo gēnu fragmentu ekspresija, HPV, HCV, BLV proteīnu epitopi.Vairāk kā 300 darbu autors,  40 patentu un autorapliecību līdzautors, LZP ekspertu padomes loceklis, BMC zinātniskais direktors, ilgstošs Eiropas projektu eksperts.

BMC vad. pētn. Dr. biol. Andris Dišlers, 2011

Intereses

• molekulārā bioloģija un bioķīmija  
• molekulārā virusoloģija  
• gēnu inženierija,
• proteīnu inženierija,
• molekulārā imunoloģija un šūnu bioloģija    

Izglītība

• Latvijas Universitātes Ķīmijas fakultāte, specialitāte – bioķīmija, 1970
• Dr.biol., LZA Apvienotā bioloģijas padome, 1975
• Dr.habil.biol., PSRS ZA Molekulārās bioloģijas institūts, Maskava, Krievija, 1988

Pieredze

• Jaunākais un vecākais zinātniskais līdzstrādnieks, LZA Organiskās sintēzes institūts, 1973-1989
• Proteīnu inženierijas laboratorijas vadītājs, LZA Organiskās sintēzes institūts, 1989-1990
• Proteīnu inženierijas laboratorijas vadītājs (1990-1994), Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs, Latvijas Universitāte
• Zinātniskais direktors, Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs, 2004-
• Latvijas Universitātes profesors (1994 - ),

Godalgas

• Latvijas Zinātņu akadēmijas korespondētājloceklis, 1990
• Latvijas Zinātņu akadēmijas īstenais loceklis, 1992
• Vissavienības komjaunatnes prēmija (kopā ar Viesturu Baumani) par darbu ciklu RNS bakteriofāgu RNS replikācijas regulācijā, 1976
• D.H.Grindeļa medaļa (firma «Grindeks», Latvija), 1997
• LR Ministru kabineta balva zinātnē, 1998

Profesionālās aktivitātes un dalība biedrībās

• Latvijas Bioķīmiķu biedrības biedrs, 1972  
• Latvijas zinātnieku savienības biedrs, 1989
• Marie Curie stipendijas projekta “Mākslīgie himērie proteīni kā diagnostikas, vakcīnu un gēnu terapijas nesēji” koordinators

Grupas

• Pauls

Projekti

• Hepatīta B core daļiņu funkcionālā uzbūve: stabila ekspresija eikariotu šūnu līnijās, attīrīšana, strukturālās īpatnības un imunoloģiska izvērtēšana
• Vektoru pārnēsātie riski Eiropā: Risku apzināšana un kontrole Rietumnīlas un Čikungajas vīrusiem (VECTORIE)
• Hepatītu B un C molekulārā epidemioloģija individualizēto terapeitisko vakcīnu radīšanai
• Transkripcijas faktoru kvantitatīvu izmaiņu molekulārie efekti vēža šūnās in vitro
• Molekulāro principu ieviešana vīrusu hepatītu diagnostikā, prognostikā, ārstēšanā un izplatības ierobežošanā
• Mākslīgas vīrusveidīgās daļiņas (VLP, virus-like particles) kā jauna vakcīnu, gēnu terapijas un diagnostikas līdzekļu platforma
• Jauni himēro vakcīnu prototipi: Rietumnīlas (WNV) vīruss.
• Uz Rietumnīlas vīrusu balstītas jaunas ģenētiskās vakcīnas racionāls dizains un standartizēts novērtējums
• Himēro melanomas vakcīnu kandidātu konstruēšana
• Kombinēta gēnu un imūnterapija hroniska hepatīta ārstēšanā
• Hepatīta vīrusu ģenētiskās mainības un persistences molekulārie mehānismi
• Malārijas vakcīna
• Hematoloģiskas malignitātes bērniem un to klīniskās īpatnības kombinētas hroniskas vīrusu infekcijas ietekmē
• Seksuāli transmisīvo slimību jaunās paaudzes diagnostika
• Jauns VLP modelis: Acetonobacter RNS faga 205 apvalka proteīna un tā himēru ekspresija un rentgenstruktūra
• Mākslīgi himērie proteīni un to pielietojums diagnostikā, vakcīnu un gēnu terapijā
• HCV, HGV un izmainīta HBV genomu molekulārais monitorings un patoloģiskā nozīme Baltijas reģionā
• Hanta vīrusa vakcīna
• Universālas klonēšanas un ekspresijas sistēmas veidošana, igūstot proteāzes mutantus
• RNS fāga apvalka balstītu himēro kapsīdu telpiskā struktūra
• E.coli mutantu veidošana - himēro RNS fāga apvalka proteīnu paaugstināti producenti
• HBV un HCV infekcijas molekulārais monitorings Latvijā: HBV un HCV genoma variācijas ar un bez HIV infekcijas klātbūtnes

Publikācijas

• Starptautiskas

• The True Story and Advantages of RNA Phage Capsids as Nanotools P Pumpēns, R Renhofa, A Dišlers, T Kozlovska, V Ose-Klinklāva, Pushko, P., K Tārs, E Grēns, Bachmann, M.F. , Intervirology, pp. 74-110 , 2016
• The true story and advantages of the famous Hepatitis B virus core particles: Outlook 2016 P Pumpēns, E Grēns , Molecular Biology, 50 (4), pp. 489-509 , 2016
• Preparation by alkaline treatment and detailed characterisation of empty hepatitis B virus core particles for vaccine and gene therapy applications A Strods, V Ose-Klinklāva, J Bogans, I Cielēns, G Kalniņš, I Radoviča-Spalviņa, A Kazāks, P Pumpēns, R Renhofa , Scientific Reports, 5, art. no. 11639 , 2015
• The Hepatitis B Virus Core Variants that Expose Foreign C-Terminal Insertions on the Outer Surface of Virus-Like Particles A Dišlers, D Skrastiņa, R Renhofa, I Petrovskis, V Ose-Klinklāva, I Liekniņa, J Jansons, P Pumpēns, I Sominska , Molecular Biotechnology, 57 (11-12), pp. 1038-1049 , 2015
• Mosaic RNA phage VLPs carrying domain III of the West Nile virus E protein. I Cielēns, L Jackeviča, A Strods, A Kazāks, V Ose-Klinklāva, J Bogans, P Pumpēns, R Renhofa , FEBS J. 281(11):2613-22 , 2014
• Hepatitis C virus hypervariable region 1 variants presented on hepatitis B virus capsid-like particles induce cross-neutralizing antibodies. Lange M, Fiedler M, Bankwitz D, Osburn W, Viazov S, Brovko O, Zekri AR, Khudyakov Y, Nassal M, P Pumpēns, Pietschmann T, Timm J, Roggendorf M, Walker A , PLoS One. 9(7):e102235 , 2014
• Fibronectin-binding nanoparticles for intracellular targeting addressed by B. burgdorferi BBK32 protein fragments. R Ranka, I Petrovskis, I Sominska, J Bogans, R Brūvere, I Akopjana, V Ose-Klinklāva, I Timofējeva, K Brangulis, P Pumpēns, V Baumanis , Nanomedicine. Jan;9(1):65-73. , 2013
• A VLP library of C-terminally truncated Hepatitis B core proteins: correlation of RNA encapsidation with a Th1/Th2 switch in the immune responses of mice. I Sominska, D Skrastiņa, I Petrovskis, A Dišlers, I Bērza, M Mihailova, J Jansons, I Akopjana, I Stahovska, D Dreiliņa, V Ose-Klinklāva, P Pumpēns , PLoS One. Sep 23;8(9):e75938. , 2013
• Chimeric derivatives of hepatitis B virus core particles carrying major epitopes of the rubella virus e1 glycoprotein. D Skrastiņa, I Petrovskis, Petraityte R, I Sominska, V Ose-Klinklāva, I Liekniņa, J Bogans, Sasnauskas K, P Pumpēns , Clin Vaccine Immunol. Nov;20(11):1719-28. , 2013
• Posttranslational modifications and secretion efficiency of immunogenic hepatitis B virus L protein deletion variants. B Niedre-Otomere, A Bogdanova-Jātniece, R Brūvere, V Ose-Klinklāva, Gerlich WH, P Pumpēns, Glebe D, T Kozlovska , Virol J. Feb 25;10:63. , 2013
• Development of virus-like particle technology from small highly symmetric to large complex virus-like particle structures. Pushko P, P Pumpēns, E Grēns , Intervirology. 56(3):141-65. , 2013
• Recombinant Semliki Forest virus vectors encoding hepatitis B virus small surface and pre-S1 antigens induce broadly reactive neutralizing antibodies B Niedre-Otomere, A Bogdanova-Jātniece, D Skrastiņa, A Zajakina, R Brūvere, V Ose-Klinklāva, Gerlich WH, Garoff H, P Pumpēns, Glebe D, T Kozlovska , Journal of Viral Hepatitis, May 17 , 2012
• Highly efficient production of phosphorylated hepatitis B core particles in yeast Pichia pastoris. J Freivalds, A Dišlers, V Ose-Klinklāva, P Pumpēns, K Tārs, A Kazāks , Protein Expr Purif. 75(2):218-24. , 2011
• Potato Virus Y-Like Particles as a New Carrier for the Presentation of Foreign Protein Stretches I Kalnciema, D Skrastiņa, V Ose-Klinklāva, P Pumpēns, A Zeltiņš , Mol Biotechnol. Dec 14. [Epub ahead of print]. , 2011
• N-terminal myristoylation - dependent masking of neutralizing epitopes in the preS1 attachment site of hepatitis B virus Bremer CM, I Sominska, D Skrastiņa, P Pumpēns, Wahed AA EI, Beutling U, Frank R, Fritz HJ, Hunsmann G, Gerlich WH, Glebe D , J Hepatol. Jul;55(1):29-37. , 2011

• Vietēja mēroga

• HBV genoma mutācijas ar lamivudīnu ārstētiem B vīrushepatīta pacientiem Latvijā. D Legzdiņa, Keišs J, G Varblane, I Sominska, Arša F, Davidjuka I, Sondore V, Vīksna L, Rozentāle B, P Pumpēns , RSU Zinātniskie raksti 208-15 , 2009
• HCV genoma izmaiņas pretvīrusu terapijas gaitā hroniskas HCV infekcijas gadījumā. G Varblane, J Jansons, I Sominska, Sondore V, Jēruma A, Arša F, Keišs J, Rozentāle B, Vīksna L, P Pumpēns , RSU Zinātniskie raksti 216-23 , 2009
• Attenuation spectrum of self-assembled system: semiconductor and virus-like nanoparticles Dekhtyar Yu, Kacanovska A, Mezinskis G, P Pumpēns, R Renhofa , Biomedical Engineering, Proceedings of International Konference. Kaunas University of Technology. Technologija 169-171 , 2008
• “Is vaccine against HCV possible?” M Mihailova, I Sominska, Viazov S, P Pumpēns , Acta Universitatis Latviensis 723: 123-43 , 2007
• Tumor-asociēto antigēnu inkorporācija vīrusveidīgās daļiņās. Balmaks R, J Freivalds, P Pumpēns, A Kazāks , Acta Universitatis Latviensis 712: 76-9 , 2007
• Hepatitis C virus molecular epidemiology in Latvia. J Jansons, G Varblane, I Sominska, P Pumpēns , Acta Universitatis Latviensis 676: 65-70 , 2004
• Synthesis of all Hepatitis B structural proteins in Semliki Forest virus expression system. T Kozlovska, A Zajakina, V Ose-Klinklāva, R Brūvere, Alekseeva J, P Pumpēns, Garoff H , Acta Universitatis Latviensis 676: 39-51 , 2004
• Subcellular localisation of internally deleted HBV core proteins. R Brūvere, Braun S, A Zajakina, Aleksejeva J, Sharipo A, Meisel H, P Pumpēns, T Kozlovska , Acta Universitatis Latviensis 676: 53-64 , 2004
• Structural features of hepatitis B virus from longterm immunosuppressed patients in Latvia. M Mihailova, I Sominska, J Jansons, Rozentals R, P Pumpēns , Proc. Latvian Acad. Sci. 57: 158-163 , 2003
• Gene therapy, what it is? P Pumpēns, V Baumanis , Latvijas Ārsts 1: 37-40 , 2001
• Vaccines and other immunobiological tools today and tomorrow. P Pumpēns, E Grēns , Latvijas Ārsts 10: 28-32 , 2001
• Gene therapy, real success V Baumanis, P Pumpēns , Latvijas Ārsts 3:40-43 , 2001
• Specific diagnostics of viral hepatitis B. Current problems. Viksna L, I Sominska, T Kozlovska, J Jansons, P Pumpēns, Arsa F, Rozentale B, Sondore V , LMA Vestis 210-213 , 2000
• Display vectors. I. Hepatitis B core particle as a display moiety. Borisova G, Borschukova O, D Skrastiņa, Mezule G, A Dišlers, I Petrovskis, V Ose-Klinklāva, Gusars I, P Pumpēns, E Grēns , Proc. Latvian Acad. Sci. 51:1-7 , 1997
• Display vectors. II. Recombinant capsid of RNA bacteriophage Qb as a display moiety. T Kozlovska, I Cielēns, I Vasiļjeva, Bundule M, Strelnikova A, A Kazāks, A Dišlers, D Dreiliņa, V Ose-Klinklāva, Gusars I, P Pumpēns , Proc. Latvian Acad. Sci. 51: 8-12 , 1997

• Patenti

• Paņēmiens tukšu un ar nukleīnskābēm pildītu hepatīta B vīrusa core-proteīna kapsīdu iegūšanai I Liekniņa, I Petrovskis, I Sominska, J Bogans, I Akopjana, P Pumpēns, A Dišlers , LR patenta pieteikuma nr. P-14-81 , 2015
• Modificēti HBV core nanokonteineri kā universāla platforma bioloģiska materiāla eksponēšanai R Renhofa, I Cielēns, A Strods, G Kalniņš, D Priede, V Ose-Klinklāva, P Pumpēns , LR patents LV 15034 , 2014
• Paņēmiens izvēlēta materiāla piešūšanai HBV core proteīna veidotajām nanodaļiņām R Renhofa, A Kazāks, A Dišlers, L Jackeviča, V Ose-Klinklāva, P Pumpēns , LR patents LV 15033 , 2014
• Anti-HCV individuālas terapeitiskas vakcīnas prototips I Sominska, J Jansons, P Pumpēns, I Petrovskis, D Skrastiņa, G. Sudmale , LR patents LV 14987 , 2013
• Paņēmiens hepatīta B vīrusa infekcijas modeļa izveidošanai A Zajakina, U Bērziņš, T Kozlovska, P Pumpēns, D Legzdiņa, Sondore V., Keišs J., Vīksna L., I Sominska, Arša F. , LR patents LV 14760 , 2013
• Immunostimulatory nucleic acid packaged particles for the treatment of hypersensitivity (8574564) Renner WA, Bachmann MF, I Cielēns, Coester CJ, Dietmeier K, Fuchs S, Manolova V, Maurer P, P Pumpēns, R Renhofa, Tissot A, Zou Yu , United States Patent 8574564 , 2013
• Immunostimulatory nucleic acid packaged particles for the treatment of hypersenstivity (AU2013/204626 A1) Renner W, Bachmann M, I Cielēns, Coester C, Dietmeier K, Fuchs S, Manolova V, Maurer P, P Pumpēns, R Renhofa, Tissot A, Zou Yu , Australian patent application AU2013/204626 A1 , 2013
• Immunostimulatory nucleic acid packaged particles for the treatment of hypersensitivity (AU 2006/325225 B2) R Renhofa, Manolova V, P Pumpēns, Fuchs S, Bachmann M, Tissot A, Coester C, Zou Yu, Dietmeier K, Renner W, Maurer P, I Cielēns, Proba K, Kinzler M , Australian patent AU 2006/325225 B2 , 2013
• Ekspresijas sistēma HBc-preS1 vīrusveidīgo daļiņu iegūšanai A Dišlers, I Petrovskis, I Liekniņa, I Bērza, J Bogans, I Akopjana, I Sominska, P Pumpēns , LR patents LV 14945 , 2013
• Molecular antigen arrays using a virus like particle derived from the ap205 coat protein. Bachmann M, Tissot A, P Pumpēns, I Cielēns, R Renhofa , EP1532167 (B1); HK1078880 (A1) , 2012
• MOLECULAR ANTIGEN ARRAY Bachmann M, Tissot A, P Pumpēns, I Cielēns, R Renhofa , Japanese Patent JP2011087580, Application Number: JP2010000248015 , 2011
• Packaging of immunostimulatory substances into virus-like particles: method of preparation and use Bachmann MF, Storni T, Maurer P, Tissot A, Schwarz K, Meijerink E, Lipowsky G, P Pumpēns, I Cielēns, R Renhofa , EP2196217 (A1); US2012301499 (A1) , 2010; 2012
• Heterologas proteīnu sekvences eksponējošu kartupeļu vīrusam PVY līdzīgo daļiņu iegūšana un izmantošana. A Zeltiņš, I Kalnciema, D Skrastiņa, V Ose-Klinklāva, P Pumpēns , LR patents Nr. 14204 , 2010
• Immunostimulatory nucleic acid packaged particles for the treatment of hypersensitivity (US2010/0303846 A1) Renner W, Bachmann MF, I Cielēns, Coester C, Dietmeier K, Fuchs S, Manolova V, Maurer P, P Pumpēns, R Renhofa, Tissot A, Zou Y, Proba K, Kinzler M , US2010/0303846 A1 , 2010
• Molecular Antigen Arrays. Bachmann MF, Tissot A, P Pumpēns, I Cielēns, R Renhofa , US 2010/0092508 A1 , 2010

• Monogrāfijas

• Construction of novel vaccines on the basis of the virus-like particles: Hepatitis B virus proteins as vaccine carriers. /in "Medicinal Protein Engineering. " pp. 205-248. P Pumpēns, Ulrich R, Sasnauskas K, A Kazāks, V Ose-Klinklāva, E Grēns , CRC Press, Taylor & Francis Group, Boca Raton London, New York , 2009
• Artificial genes for chimeric virus-like particles. /in "Artificial DNA: Methods and Applications." pp. 249-327 P Pumpēns, E Grēns , CRC Press LLC, Boca Raton , 2002

• Konferenču tēzes

• Hepatitis B virus nucleocapsid particles produced in eukaryotic cells: Properties and purification K Spunde, A.Eihentale, A Zajakina, T Kozlovska, P Pumpēns , European Biotechnology Congress 2014 , 2014
• Successful creation of chimeric virus-like particles maintaining fibronectin-binding property from B.burgdorferi BBK32 protein R Ranka, I Petrovskis, I Sominska, K Brangulis, P Pumpēns, V Baumanis , XII International Jena Symposium on Tick-borne Diseases. Weimar, Vācija , 2013
• Individualized Anti-HCV/HBV Vaccine Prototype. I Sominska, D Skrastiņa, I Petrovskis, V Ose-Klinklāva, I Akopjana, I Stahovska, P Pumpēns , IX Annual Conference of the New Visby Network on Hepatitis C. Saint Petersburg, Russia. , 2012
• Presentation of individual Hepatitis C Hipervariable region. G Varblane, I Sominska, I Petrovskis, V Ose-Klinklāva, Sondore V, Arša F, P Pumpēns , IX Annual Conference of the New Visby Network on Hepatitis C. Saint Petersburg, Russia. , 2012
• Packaging of Nonmethylated CG motifs into Virus-Like Particles Bearing Hepatitis C Virus (HCV) Nonstructural Protein 3 Sequences for Induction of Vigorous HCV Specific Cytotoxic T Cell Response M Mihailova, A Dovbenko, J Bogans, I Petrovskis, V Ose-Klinklāva, I Sominska, P Pumpēns , 4th Annual Proteins Congress & Vaccines Congress, London, UK , 2011
• Hepatitis C virus vaccine candidates from chimeric hepatitis B core virus-like particles carrying different fragments of HCV non-structural protein 3 M Mihailova, A Dovbenko, J Bogans, A. Walker, V Ose-Klinklāva, I Sominska, S. Viazov, P Pumpēns , 24th International Conference on Antiviral Research,Sofia, Bulgaria , 2011
• A new vaccine strategy for HCV: presentation of hepatitis C virus hypervariable region 1 on HBV capsid-like particles. Milena Lange, Sergei Viazov, Olena Brovko, Hanaa M. Alam El-Din, Nehal Hussien, Yuri Khudyakov, Michael Nassal,, P Pumpēns, Michael Roggendorf, Abdel-RahmanZekri, Andreas Walker , 18th International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses, Seattle, Washington, USA, P3.10, p142 , 2011
• Jauna vīrusveidīgo daļiņu virsmas enzimātiskā modifikācijas sistēma D Žuļenkovs, I Petrovskis, P Pumpēns, A Leončiks , Apvienotais Pasaules latviešu zinātnieku 3. kongress un Letonikas 4. kongress 24.-27./oktobris/2011 Medicīnas zinātne un Latvijas sabiedrības veselība XXI gadsimtā Medicīnas sekcija / p.91. , 2011
• Adresētās vīrusiem līdzīgās daļiņas specifiskai mijiedarbībai ar eikariotu šūnām R Renhofa, I Cielēns, I Akopjana, G Kalniņš, Ārgule D, P Pumpēns, A Strods , Apvienotajā pasaules latviešu zinātnieku III kongresā un Letonikas IV kongresā, Rīga , 2011

Ātrās saites

• BMC e-pasts
• Iepirkumi
• Iepirkumu arhīvs
• Masu medijiem
• EURAXESS